N末端ペプチドシークエンス

概要

精製したタンパク質・ペプチドのアミノ酸配列を、エドマン分解法を用いN末端側から1残基ずつ順次同定します。

質量分析のようにデータベースに依存しないため、配列情報が乏しいタンパク質の解析にも適しています。

業界最安値水準で、高品質なペプチドシークエンスサービスをご提供しております。

試験方法

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N末端ペプチドシークエンスは、エドマン分解法を用い、タンパク質やペプチドのN末端側から1残基ずつ順次する分析です。

質量分析のようにデータベースに依存しないため、配列情報が乏しいタンパク質の解析にも適しています。

タンパク質の同定や精製確認、発現タンパク質の品質評価など、研究・開発から品質管理まで幅広い用途でご利用いただけます。

※タンパク質の同定

目的タンパク質のN末端配列を確認します。

※発現タンパク質の品質確認

タグの有無やプロセシングの確認に利用できます。

※精製確認

目的タンパク質が正しく精製されているか評価します。

※プロセッシング部位の確認

成熟タンパク質の切断位置を確認します。

試験項目・料金一覧

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試験項目料金(税別)
ペプチドシークエンス 1検体(5残基まで)48,000円
+1残基追加毎4,500円
システイン残基検出(還元アルキル化)30,000円
脱塩・濃縮15,000円
試験項目料金(税別)
ペプチドシークエンス 1検体(5残基まで)48,000円
+1残基追加毎4,500円
システイン残基検出(還元アルキル化)30,000円
脱塩・濃縮15,000円

依頼書ダウンロード

N末端ペプチドシークエンス分析受託依頼書(Excel形式)はこちらからダウンロードしてご使用ください。

解析の流れ

必要試料量や濃度については事前にお問い合わせください。

STEP 1
お問い合わせ、
事前相談

STEP 2
試料送付

STEP 3
前処理・解析

STEP 4
データ解析

STEP 5
報告書提出

STEP 1
お問い合わせ、事前相談

STEP 2
試料送付

STEP 3
前処理・解析

STEP 4
データ解析

STEP 5
報告書提出

よくある質問

Q

使用機器は何ですか?

A

Applied Biosystems社のProcise492HTです。

Q

サンプル量はどのくらい必要ですか?

A

基本的な装置の性能は10pmol以上となっています。より微量でも解析できる場合もありますが、試料の純度はより重要な要素です。

Q

システインは検出できますか?

A

システイン残基は壊れてしまい検出できません。必要な場合は、還元アルキル化が必要です。弊社で行う場合は、4-ビニルピリジンでアルキル化し、追加料金30,000円となります。

Q

溶液の分析もできますか?

A

試料以外の不揮発性成分を含まなければ、分析可能です。緩衝液、塩類を含む場合は脱塩が必要です。弊社で脱塩する場合は15,000円追加料金となります。

Q

アクリルアミドゲルの状態で分析できますか?

A

アクリルアミドゲルからは分析できません。ブロットが必須です。

Q

ニトロセルロース膜に転写した試料も分析できますか?

A

ニトロセルロースは、ペプチドシークエンスの試薬に耐性がないため、使用できません。

Q

PVDF膜の染色は何が良いですか?

A

染色は、CBB R250が最も適しています。感度が良く、分析を妨害しません。

Q

リン酸化は検出できますか?

A

リン酸化スレオニン、リン酸化チロシンは検出できません。リン酸化セリンは感度が落ちますがデヒドロアラニンとして検出可能な場合があります。

Q

N末がブロックされている可能性があります。

A

N末が、アセチル化、ピログルタミル化など、ブロックされていると分析できません。デブロックは弊社では受託しておりません。

Q

解析残基数を決めずに、読めるだけ読んで欲しいのですが。

A

ご相談下さい。

Q

読めなかった場合も料金はかかるのですか?

A

読めなくても試薬は同じだけ使用しますので、料金はかかります。

Q

糖鎖があるとどうなりますか?

A

糖鎖のついた残基は、検出されず、そのサイクルはブランクとなります。

Q

複数のペプチドが混ざっている場合はどうなりますか?

A

単一に精製された試料を分析する事が基本的な考えです。複数混ざっている場合は、その割合を反映した結果となります。配列既知のペプチドの場合は比較的解釈が容易ですが、未知のペプチドの場合は配列の特定ができない場合もあります。

Q

PVDF膜に転写した試料はどのように送ればよいですか?

A

PVDF膜に転写された試料は乾燥していれば安定ですので、充分乾燥させて目的のバンドを切り抜き、エッペンドルフ型チューブなどに入れて室温でお送り下さい。CBBは分析を妨害しないのと、弊社でトリミングをする場合がありますので、試料はCBBで染まっていた方が良いです。バックグラウンドは脱色して下さい。また、乾燥させる前に、清浄な容器と純水で充分すぎるほどすすいで下さい。

Q

溶液の試料はどのように送ればよいですか?

A

溶液の場合は、現在保管されている状態(冷蔵あるいは冷凍)で お送り下さい。凍結融解を最小限にしたい為です。

Q

粉末、個体の試料は分析できますか?

A

凍結乾燥などされた試料は、弊社で20%アセトニトリル、0.1%TFAに溶解してから分析します。もし、より適切な溶媒がある場合は、お知らせ下さい。

お問い合わせ

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